Kapal-kapal pelni menjadi tulang punggung transportasi penumpang dan barang via laut ke daerah di Indonesia. Berikut ini adalah beberapa nama kapal dan rute tujuan yang dilayani oleh kapal pelni:
- DOBONSOLO
Rute : TANJUNG PRIOK – SURABAYA – MAKASSAR – BAU-BAU – SORONG – MANOKWARI – JAYAPURA
- GUNUNG DEMPO
Rute : TANJUNG PRIOK – SURABAYA – MAKASSAR – AMBON – SORONG – BIAK – JAYAPURA
- LABOBAR
Rute : TANJUNG PRIOK – SURABAYA – MAKASSAR – SORONG – MANOKWARI – NABIRE – JAYAPURA
- LAMBELU
Rute: KIJANG -TANJUNG PRIOK – SURABAYA – MAKASSAR – BAU-BAU – NAMLEA – AMBON – TERNATE – BITUNG
- TIDAR
Rute : TANJUNG PRIOK – SURABAYA – MAKASSAR – AMBON – BANDA – TUAL – DOBO – KAIMANA – FAKFAK
- LAWIT
Rute : TANJUNG PRIOK – BENGKULU – PADANG – GUNUNG SITOLI/NIAS – SIBOLGA
- SINABUNG
Rute : SURABAYA – MAKASSAR – BAU-BAU – BANGGAI – BITUNG – TERNATE – SORONG – MANOKWARI – BIAK – SERUI – JAYAPURA
- DOROLONDA
Rute : SURABAYA – BALIKPAPAN – PANTOLOAN – BITUNG – TERNATE – SORONG – MANOKWARI – NABIRE – SERUI – JAYAPURA
Untuk bisa mengetahui selengkapnya bisa dilihat pada website PT. PELNI di http://www.pelni.co.id